The şokolad allergiyası olsalar da mümkündür nadir. Bu vəziyyətdə allergik fenomen kakaonun zülallarından qaynaqlanır. Allergiya xəstəsi nəfəs almaqda çətinlik çəkir, baş ağrısı, döküntü, taxikardiya, qaşınma və mədədə yanma hissi keçirir.

Bu simptomlar şokolad təşkil edən elementlərə allergiyası olan insanlarda da müşahidə edilə bilər (qoz -fındıq, süd zülalları və s..), buna görə də həqiqətən kakaoya alerjisi olmasa da.